[Николай]

Это не вопрос, а сразу частичное решение проблемы. Т. к. я в своё время не смог найти на него ответ в интернете.

Система: Windows XP

Итак, с определённого момента пропадают значки из трея (речь не о функции сокрытия неиспользуемых значков). Пропадают в том числе и те, которые регулярно используются. Например, значок Skype.

Очевидно было, что это какой-то глюк. Но непонятно было, с чем он связан. Оказалось, что он проявляется после установки WinAmp.

Удаление WinAmp и перезагрузка системы (иногда несколько перезагрузок) решают проблему.

Более детально не изучал. Поэтому не знаю, как исправить проблему сохранив определённый набор программ на компьютере. Если кто-то сталкивался с данной проблемой и как-то изучал её - отпишите здесь о результатах.