Есть простая бесплатная программа, предназначенная именно для этого -
mp3DirectCut
или
http://tfile.ru/forum/viewtopic.php?t=409495
Описание: Компактная утилита для прямого редактирования MP3-файлов: позволяет обрезать тишину в начале и/или конце файла, нормализировать звук, а также плавно убирать его в конце композиции, обьединять файлы, редактировать ID3-тэги и записывать Mp3 непосредственно на диск - без декомпрессии в PCM-формат. ( поддерживаются кодеки ACM и LAME).