Ищу секвенсор, который может такое...

[remountier]

dixxiaAndrey,
Было бы великолепно, если бы Вы описали задачу, что конкретно Вы хотите получить в результате всех этих манипуляций, а то мы пытаемся поставить диагноз по фотографии.

чтобы миди файлы из папки были слинкованы с проектом

Они всегда слинкованы. В любой ДАВ.

Я сохраняю проект 1, выхожу из ФЛ или Ableton, меняю в папке миди файлы 1. mid, 2. mid и 3. mid на другие миди с такими же именами, запускаю проект 1 и у меня играет проект уже с другими мелодиями?

Это может любая ДАВ.